JST CREST「生命動態」洪チーム

プロジェクト

JST CREST
研究領域「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」

研究課題
「動的遺伝子ネットワークの多次元構造解析による高精度な細胞分化制御技術の開発」

研究代表者

洪 実
慶應義塾大学 医学部 教授

ニュース

第1回班会議を開催いたしました。

第1回CREST生命動態領域会議が沖縄科学技術大学院大学で開催され、洪実教授が発表をいたしました。[領域の報告PDF]

統計数理研究所学協働プログラム「応用トポロジーとシステムバイオ:数理医学の新たな挑戦」(大阪)に研究メンバーが数名参加し、洪 実 教授が「幹細胞の遺伝子ネットワーク」と題して、発表をいたしました。

第2回班会議を開催いたしました。

第3回班会議を開催いたしました。

第4回班会議を開催いたしました。

第5回班会議を開催いたしました。

第6回班会議を開催いたしました。

第2回CREST生命動態領域会議が日本科学未来館で開催され、洪実教授が口頭発表、中武さん、合田さん、西村さんがポスター発表をいたしました。慶應義塾大学システム医学研究室からは洪 実教授、洪 繁専任講師、中武助教が参加しました。 CREST洪チームからは、合田さん、小原さん、阿久津さん、的場さん、西村さんが参加しました。[領域の報告PDF]

第2回CREST生命動態領域会議のポスター発表において、慶應義塾大学の中武悠樹助教が「ポスター賞」を受賞しました。

第1回数理デザイン道場が産業技術総合研究所 生命情報工学研究センターにて開催され、合田さん、西村さんが参加しました。

第7回班会議を開催いたしました。

第8回班会議を開催いたしました。山本 雅 研究総括、深見 希代子 領域アドバイサーにもご出席いただき、活発なディスカッションを行いました。

第9回班会議を開催いたしました。

第10回班会議を開催いたしました。

第2回数理デザイン道場がIBM天城ホームステッドにて開催され、若林さん、西村さんが参加いたしました。

第11回班会議を開催いたしました。

第12回班会議を開催いたしました。

第3回CREST生命動態領域会議が沖縄科学技術大学院大学にて開催され、洪実教授が発表いたしました。慶應義塾大学システム医学研究室からは洪 実教授、洪 繁専任講師、合田さん、CREST洪チームからは、阿久津さん、的場さん、伊東さん、西村さんが参加しました。[領域の報告PDF]

第3回数理デザイン道場が沖縄科学技術大学院大学シーサイドハウスにて開催され、合田さん、西村さんが参加し、合田さんが口頭発表とポスター発表、西村さんがポスター発表をいたしました。

第13回班会議を開催いたしました。

第14回班会議を開催いたしました。

第4回数理デザイン道場が大阪ガス研修所奥池ロッジにおいて開催され、合田さん、西村さんが参加いたしました。

第15回班会議を開催いたしました。

山本 雅 研究総括をはじめ領域アドバイサーの先生方と活発なディスカッションを行いました。

第16回班会議を開催いたしました。

JST CREST・さきがけ4領域合同国際シンポジウム 「the international symposium, "Structural Biological Dynamics: From Molecules to Life with 60 trillion Cells"」が東京大学伊藤謝恩ホールにて開催されました。

慶應義塾大学の中武助教が、「Large-scaled transgene activation on human embryonic stem cells」(Yuhki Nakatake, Norio Goda, Nana Chikazawa-Nohtomi, Miyako Murakami, Miki Sakota, Shunichi Wakabayashi, Mak Siu San, Martin Jakt, Tomoo Ueno, Misako Matsushita, Mayumi Oda, Utsumi Noriko, Madoka Ishikawa-Hirayama, Noriko Itoh, Motohiko Tanino, Yukari Ikeda, Hiroshi Iijima, Takumi Miura, Masakazu Machida, Kahori Minami, Shigeru B.H.Ko, Kunihiro Nishimura, Ryo Matoba, Hidenori Akutsu, Osamu Ohara, and Minoru S.H. Ko)と題してポスター発表を行いました。

JSTとA*starとの共催でシンガポールBiopolisにて開催されたICSB2015(16th International Conference on Systems Biology)に慶應義塾大学の中武助教が参加し、ポスター発表を行いました。

第17回班会議を開催いたしました。

山本 雅 研究総括をはじめ領域アドバイサーの先生方と活発なディスカッションを行いました。

従来の班メンバーに加えて、メンバーを拡充し、遺伝子ネットワークの解析のために数理解析グループキックオフミーティングを開催いたしました。

第4回CREST生命動態領域会議が上野・国立科学博物館において開催され、日本館において開催され、重厚な会議室の中、会議が開催されました。研究代表者である洪実教授(慶應義塾大学医学部・システム医学研究室)が発表いたしました。合わせて、ショートプレゼンテーションとして、合田さん、西村さんが発表いたしました。慶應義塾大学システム医学研究室からは洪 実教授、洪 繁専任講師、中武助教、合田さん、CREST洪チームからは、阿久津さん、小原さん、的場さん、西村さんが参加しました。

第5回数理デザイン道場が上野・国立科学博物館 地球館にて開催され、中武さん、合田さん、西村さんが参加いたしました。

第18回班会議を開催いたしました。

平成28年度から数理解析チームとして、古澤グループ(理化学研究所多階層生命動態研究チーム生命システム研究センター・チームリーダー・古澤 力先生)、木立グループ (東京大学大学院新領域創成科学研究科メディカル情報生命専攻 情報生命科学群・准教授 木立 尚孝先生) 、松本グループ(理化学研究所、情報基盤センター、バイオインフォマティクス研究開発ユニット・研究員 松本 拡高先生) を作り、各先生方に研究に参加していただくことなりました。

 

数理解析グループミーティングを開催いたしました。

 

第19回班会議を開催いたしました。

研究概要

本研究では、ヒト幹細胞の形態と機能を調節する転写因子全てを、ひとつずつ操作することによって、全遺伝子の発現パターンが時間とともに、どのよう に変化していくかを詳細に調べます。この前例のない大規模かつ高精度のデータを最新のコンピュータで解析することによって、今まで不可能とされてきた、多 様で複雑な転写因子ネットワークの構造とその動態解明に挑みます。
ネットワークを人為的に精密制御できる方法を開発することで、生命の数理的理解をめざす のみならず、再生医療、医療工学で必要とされる様々な細胞種を自由自在に創り出す基盤技術も創出します。

 動的遺伝子ネットワークの多次元構造解析による高精度な細胞分化制御技術の開発

ねらい1

特定の転写調節因子(Transcription factor, 以下TF)を発現誘導できるようなヒト胚性幹細胞(Embryonic stem cell, 以下ES細胞)(TF-hESC)セットを作製、保存、分配する。

ねらい2

TF-hESCセットを活用し、動的遺伝子ネットワークの多次元構造を理解する

ねらい3

TF-hESCセットを活用し、ヒトES細胞の特定の細胞・組織への分化を高精度に制御する方法を探索する。

メンバー

研究代表者

洪 実
慶應義塾大学 医学部 教授

研究分担者

阿久津 英憲
独立行政法人国立成育医療研究センター再生医療センター生殖・細胞医療研究部 室長
小原 收
財団法人かずさDNA研究所ヒトゲノム研究部 研究部長 副所長
西村 邦裕
株式会社テンクー 代表取締役社長
的場 亮
株式会社DNAチップ研究所 代表取締役社長
古澤 力
理化学研究所多階層生命動態研究チーム生命システム研究センター チームリーダー
木立 尚孝
東京大学大学院新領域創成科学研究科メディカル情報生命専攻 情報生命科学群 准教授
松本 拡高
理化学研究所情報基盤センターバイオインフォマティクス研究開発ユニット 研究員

研究グループ

洪グループ
  • 洪 実 (慶應義塾大学医学部 坂口光洋記念システム医学講座 教授)
  • 洪 繁 (慶應義塾大学医学部 坂口光洋記念システム医学講座 准教授)
  • 小田 真由美 (慶應義塾大学医学部 坂口光洋記念システム医学講座 助教)
  • 中武 悠樹 (慶應義塾大学医学部 坂口光洋記念システム医学講座 助教)
  • 石黒 啓一郎 (慶應義塾大学医学部 坂口光洋記念システム医学講座 特任講師)
  • 秋山 智彦 (慶應義塾大学医学部 坂口光洋記念システム医学講座 特任助教)
  • 合田 徳夫 (慶應義塾大学医学部 坂口光洋記念システム医学講座 特任助教(非常勤))
  • 若林 俊一 (慶應義塾大学医学部 坂口光洋記念システム医学講座 特任研究員)
  • 村上 都湖 (慶應義塾大学医学部 坂口光洋記念システム医学講座 特任研究員)
  • 納富(近澤) 奈々 (慶應義塾大学医学部 坂口光洋記念システム医学講座 特任研究員)
  • 齋藤 花華 (慶應義塾大学医学研究科 修士課程1年)
阿久津グループ
  • 阿久津 英憲(国立成育医療研究センター 再生医療センター生殖・細胞医療研究部 幹細胞・生殖学研究室 室長)
  • 三浦 巧(国立成育医療研究センター 再生医療センター生殖・細胞医療研究部 研究員)
  • 町田 正和(国立成育医療研究センター 再生医療センター生殖・細胞医療研究部 研究員)
  • 南 佳ほり(国立成育医療研究センター 再生医療センター生殖・細胞医療研究部 研究員)
西村グループ
  • 西村 邦裕(株式会社テンクー 代表取締役社長)
的場グループ
  • 的場 亮(株式会社DNAチップ研究所 代表取締役社長)
  • 伊東 紀子(株式会社DNAチップ研究所 研究員)
  • 石川 円(株式会社DNAチップ研究所 研究員)
古澤グループ
  • 古澤 力(理化学研究所多階層生命動態研究チーム生命システム研究センター チームリーダー)
木立グループ
  • 木立 尚孝(東京大学大学院新領域創成科学研究科メディカル情報生命専攻 情報生命科学群 准教授)
松本グループ
  • 松本 拡高(理化学研究所 情報基盤センター バイオインフォマティクス研究開発ユニット 研究員)

実績

論文発表などが行われた際に順次、公開していきます。